Journée thématique BILGWAS Nantes - jeudi 28 janvier 2010
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Description [top] |
Dans la continuité des onze séminaires (17 intervenants) initiés depuis avril 2007 dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL (Bio-Informatique Ligérienne), la journée thématique du 28 janvier 2010, organisée à Nantes, est dédiée à la
génétique d'association et plus particulièrement aux études
d'association pangénomiques.
En épidémiologie génétique, les études d'association pangénomiques (genome-wide association studies - GWASs) examinent des sites particuliers du génome, les marqueurs génétiques, afin d'identifier les associations entre ces derniers et un phénotype (maladie, pression sanguine, poids ...). Les marqueurs génétiques sont des sites privilégiés pour identifier des variations génétiques entre individus, et plus particulièrement entre témoins et malades. Le génotypage haut-débit de marqueurs génétiques comme les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) permet de caractériser des centaines de milliers, voire un million de variants par individu, ouvrant l'ère des analyses pangénomiques.
L'objectif de cette journée consiste à rassembler des chercheurs en bio-informatique, biologie, génétique et bio-statistiques, s'intéressant à la conception, la mise en oeuvre et la validation d'études d'association pangénomiques.
Parce que la capacité de la salle
d'accueil est limitée, l'inscription est obligatoire (mais gratuite).
La procédure est la suivante :
envoyer un mail à : christine.sinoquet@univ-nantes.fr, obligatoirement avec le Sujet: bilgwas <nom> <matin/apres-midi/journee>.
exemple : bilgwas sinoquet matin, pour assister aux exposés du matin
bilgwas sinoquet apres-midi, pour assister aux exposés de l'apres-midi
bilgwas sinoquet journee, pour assister à toute la journée
DATE LIMITE d'INSCRIPTION pour les membres des équipes partenaires du projet BIL : mercredi 06 janvier 2010, 17H00.
Les membres des équipes partenaires qui se sont inscrits recevront une confirmation le jeudi 07 janvier 2010.
DATE LIMITE d'INSCRIPTION pour les personnes extérieures : lundi 13 janvier 2010, 12H00.
Les personnes extérieures qui se sont inscrites recevront une confirmation le jeudi 14 janvier 2010.
La journée se déroulera à Nantes, à l'Institut de Recherche
Thérapeutique (IRT UN, 8 quai Moncousu, Nantes).
plan d'accès
Pour les réservations auprès des hôtels, attention à retenir à l'avance : l'édition 2010 de la "Folle Journée de Nantes" débute à partir du 27 janvier.
hôtels
en centre-ville (liste non exhaustive) :
une étoile
deux étoiles
trois étoiles
office
du tourisme Nantes, hébergement hôtelier
office du tourisme
Nantes, 0 892 464
044
Equipe COD, LINA UMR CNRS 6241, dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL, avec le soutien de l'Unité Inserm UMR 915 / Institut du Thorax / lnstitut Fédératif de Recherche Thérapeutique (IFR26).
Christine Sinoquet
LINA UMR CNRS 6241, Equipe COD - Université de Nantes, Faculté des Sciences et Techniques de Nantes
d'association pangénomiques.
En épidémiologie génétique, les études d'association pangénomiques (genome-wide association studies - GWASs) examinent des sites particuliers du génome, les marqueurs génétiques, afin d'identifier les associations entre ces derniers et un phénotype (maladie, pression sanguine, poids ...). Les marqueurs génétiques sont des sites privilégiés pour identifier des variations génétiques entre individus, et plus particulièrement entre témoins et malades. Le génotypage haut-débit de marqueurs génétiques comme les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) permet de caractériser des centaines de milliers, voire un million de variants par individu, ouvrant l'ère des analyses pangénomiques.
L'objectif de cette journée consiste à rassembler des chercheurs en bio-informatique, biologie, génétique et bio-statistiques, s'intéressant à la conception, la mise en oeuvre et la validation d'études d'association pangénomiques.
Lors de la journée, cinq conférenciers invités présenteront un ensemble de travaux relatifs à des avancées récentes dans le domaine.
mots-clés : génétique d'association, analyse pangénomique, inférence statistique, inférence d'haplotypes
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Programme [top] |
| 10H00-11H00 | David Balding | Statistical methods for association analyses in
the resequencing era
Institute of Genetics, University College London |
| 11H00-11H30 | pause | |
| 11H30-12H20 | Cédric Coulonges | Aspects pratiques d'analyse des GWAS Chaire de Bioinformatique, Conservatoire National des Arts et Métiers |
| 14H15-15H15 | Lachlan Coin | Genome-wide association analyses with CNV data
Division of Epidemiology, Public Health and Primary Care, Imperial College London |
| 15H15-16H05 | Olivier Delaneau | Inférence des haplotypes et ses applications dans les
GWAS
Chaire de Bioinformatique, Conservatoire National des Arts et Métiers |
| 16H05-16H35 | pause | |
| 16H35-17H25 | Mickael Guedj | Statistiques locales pour le traitement des études
génétiques d'association à grande échelle (GWAS)
Ligne nationale contre le cancer |
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Inscription [top] |
La procédure est la suivante :
envoyer un mail à : christine.sinoquet@univ-nantes.fr, obligatoirement avec le Sujet: bilgwas <nom> <matin/apres-midi/journee>.
exemple : bilgwas sinoquet matin, pour assister aux exposés du matin
bilgwas sinoquet apres-midi, pour assister aux exposés de l'apres-midi
bilgwas sinoquet journee, pour assister à toute la journée
DATE LIMITE d'INSCRIPTION pour les membres des équipes partenaires du projet BIL : mercredi 06 janvier 2010, 17H00.
Les membres des équipes partenaires qui se sont inscrits recevront une confirmation le jeudi 07 janvier 2010.
DATE LIMITE d'INSCRIPTION pour les personnes extérieures : lundi 13 janvier 2010, 12H00.
Les personnes extérieures qui se sont inscrites recevront une confirmation le jeudi 14 janvier 2010.
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Lieu de la journée[top] |
plan d'accès
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Logistique [top] |
Pour les réservations auprès des hôtels, attention à retenir à l'avance : l'édition 2010 de la "Folle Journée de Nantes" débute à partir du 27 janvier.
plan
de la ville de Nantes
plan
général des lignes
de bus et de tramway nantais
hôtels
en centre-ville (liste non exhaustive) :une étoile
deux étoiles
trois étoiles
office
du tourisme Nantes, hébergement hôtelier office du tourisme
Nantes, 0 892 464
044|
Organisation et contact [top] |
Equipe COD, LINA UMR CNRS 6241, dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL, avec le soutien de l'Unité Inserm UMR 915 / Institut du Thorax / lnstitut Fédératif de Recherche Thérapeutique (IFR26).
Christine Sinoquet
LINA UMR CNRS 6241, Equipe COD - Université de Nantes, Faculté des Sciences et Techniques de Nantes
Christian Dina
IRT UN, Institut du Thorax, INSERM UMR915 CNRS ERL3147, Nantes
dernière
modification 15 janvier 2010, adaptation d'après modèle Journée
Satellite http://www.bioinformatics.ic.ac.uk/slebre/|
Transparents [top] |
| David Balding | Statistical methods for association analyses in the resequencing era |
| Cédric Coulonges | Practical aspects in GWAS analysis |
| Lachlan Coin | Finding structural variants associated with disease |
| Olivier Delaneau | Haplotype inference and applications |
| Mickael Guedj | Local Statistics for Genome-Wide Association Studies |