Journée thématique BILBI Nantes - jeudi 22 octobre 2010
|
Description [top] |
Dans la continuité des onze séminaires (17 intervenants) initiés depuis avril 2007 dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL (Bio-Informatique Ligérienne) et après la journée thématique BILGWAS du 28 janvier 2010, le projet BIL et le projet fédérateur Biogenouest de Biologie Intégrative organisent conjointement une journée
"Biologie Intégrative" BILBI. A cette occasion, des experts interviendront sur différents aspects de l'intégration des
données *omics.
La biologie intégrative est une discipline qui ne se focalise pas sur l'étude d'un seul gène, d'une seule molécule, mais qui cherche au contraire à comprendre le fonctionnement d'un ensemble d'éléments, généralement à différentes échelles. Un organisme, un fragment de tissu ou même une cellule sont des systèmes complexes, siège de nombreuses fonctions. Permettant l'accès aux données génomiques, protéomiques, métabolomiques, interactomiques ... produites par ces systèmes, les nouvelles technologies, alliées à la bio-informatique, ouvrent la voie au décryptage du fonctionnement des systèmes vivants. Ces données doivent être intégrées avant leur exploitation et leur interprétation.
Lors de la journée, six conférenciers invités présenteront un ensemble de travaux relatifs à des avancées récentes dans le domaine.
Les conférences seront données en français.
Détails et Inscription sur http://www.genouest.org/spip.php?article831
L'inscription est gratuite mais obligatoire. Date limite: lundi 11 octobre 2010. Inscriptions closes.
Liste des inscrits
Cette journée aura lieu le Jeudi 21 octobre 2010 à l'Institut de
Recherche en Communications et Cybernétique de Nantes ( Ecole Centrale de
Nantes / IRCCyN).
plan d'accès
hôtels
en centre-ville (liste non exhaustive) :
une étoile
deux étoiles
trois étoiles
office
du tourisme Nantes, hébergement hôtelier
office du tourisme
Nantes, 0 892 464
044
Equipe COD, LINA UMR CNRS 6241, dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL,
en partenariat avec le Projet fédérateur Biogenouest de Biologie Intégrative.
Comité d'organisation :
Rémi Houlgatte, IRTUN, INSERM U915, Nantes, Biogenouest Consortium & Projet BIL
Charles Pineau, INSERM, Plate-forme Protéomique Haut Débit, Rennes Biogenouest Consortium
Nolwenn Le Meur, IRISA Symbiose, Université de Rennes, Biogenouest Consortium
Daniel Baron, IRTUN, INSERM U915, Nantes, Biogenouest Consortium
Christine Sinoquet, LINA/UMR CNRS 6241, Equipe COD, Université de Nantes, Projet BIL
Oliver Roux, ECN/IRCCyN UMR CNRS 6597, Equipe MOVES, projet BIL
Pour plus d'informations:
Projet fédérateur Biogenouest de Biologie Intégrative http://int-gen.genouest.org/
Projet de Bioinformatique Ligérienne BIL http://www.info.univ-angers.fr/bil/index.php
dernière modification 15 décembre 2010, adaptation d'après modèle Journée Satellite http://www.bioinformatics.ic.ac.uk/slebre/
La biologie intégrative est une discipline qui ne se focalise pas sur l'étude d'un seul gène, d'une seule molécule, mais qui cherche au contraire à comprendre le fonctionnement d'un ensemble d'éléments, généralement à différentes échelles. Un organisme, un fragment de tissu ou même une cellule sont des systèmes complexes, siège de nombreuses fonctions. Permettant l'accès aux données génomiques, protéomiques, métabolomiques, interactomiques ... produites par ces systèmes, les nouvelles technologies, alliées à la bio-informatique, ouvrent la voie au décryptage du fonctionnement des systèmes vivants. Ces données doivent être intégrées avant leur exploitation et leur interprétation.
Lors de la journée, six conférenciers invités présenteront un ensemble de travaux relatifs à des avancées récentes dans le domaine.
Les conférences seront données en français.
mots-clés : biologie intégrative, intégration de données du vivant
|
Programme [top] |
| 9h30 | accueil des participants | |
| 10h-10h50 | Jacques Rougemont | Analysis of ChIP-seq data with an application to circadian
rhythms. Bioinformatics & Biostatistics Core Facility -EPFL School of Life Sciences - Lausanne |
| 10h50-11H10 | pause | |
| 11h10-11h50 | Marie de Tayrac | Integrative genome-wide analysis: application to the study
of glioblastoma. INSERM U946, Fondation Jean Dausset - CEPH, Paris |
| 11h50-12h30 | Pierre Tufféry | MobyleNet: service integration over distributed web portals. Molécules Thérapeutiques in silico (MTi, Université Paris Diderot - Inserm UMR-S 973 |
| 12h30-14h30 | déjeuner (buffet)
| |
| 14h30-15h20 | Philippe Rocca-Serra | Reporting and integration of experimental data: challenges,
tools, resources. Oxford e-Research Centre (OeRC), Oxford University |
| 15h20-15H40 | pause | |
| 15h40-16h20 | Jean-François Gibrat | The Microbiogenomics warehouse: extraction and integration
of relevant information from heterogeneous data provided by genomic
comparisons. Unité Mathématique, Informatique et Génome (MIG) INRA, Jouy en Josas |
| 16h20-17h00 | Hadi Quesneville | GnpIS: an information system for plant breeding. UR1164 URGI Unité de Recherche Génomique-Info INRA, Versailles |
|
Inscription [top] |
L'inscription est gratuite mais obligatoire. Date limite: lundi 11 octobre 2010. Inscriptions closes.
Liste des inscrits
|
Lieu de la journée[top] |
plan d'accès
|
Logistique [top] |
plan
de la ville de Nantes
plan
général des lignes
de bus et de tramway nantais
hôtels
en centre-ville (liste non exhaustive) :une étoile
deux étoiles
trois étoiles
office
du tourisme Nantes, hébergement hôtelier office du tourisme
Nantes, 0 892 464
044|
Organisation et contact [top] |
Equipe COD, LINA UMR CNRS 6241, dans le cadre du projet de Recherche en Bio-Informatique BIL,
en partenariat avec le Projet fédérateur Biogenouest de Biologie Intégrative.
Comité d'organisation :
Rémi Houlgatte, IRTUN, INSERM U915, Nantes, Biogenouest Consortium & Projet BIL
Charles Pineau, INSERM, Plate-forme Protéomique Haut Débit, Rennes Biogenouest Consortium
Nolwenn Le Meur, IRISA Symbiose, Université de Rennes, Biogenouest Consortium
Daniel Baron, IRTUN, INSERM U915, Nantes, Biogenouest Consortium
Christine Sinoquet, LINA/UMR CNRS 6241, Equipe COD, Université de Nantes, Projet BIL
Oliver Roux, ECN/IRCCyN UMR CNRS 6597, Equipe MOVES, projet BIL
Pour plus d'informations:
Projet fédérateur Biogenouest de Biologie Intégrative http://int-gen.genouest.org/
Projet de Bioinformatique Ligérienne BIL http://www.info.univ-angers.fr/bil/index.php
dernière modification 15 décembre 2010, adaptation d'après modèle Journée Satellite http://www.bioinformatics.ic.ac.uk/slebre/